Totalfosforkoncentrationen under 2014–2016 indikerar i huvudsak god eller hög status med avseende på näringsämnen. Fyra av de elva undersökta stationerna uppnår måttlig status men ligger mycket nära gränsen till god. Bedömningarna för syreförhållanden påvisar överlag måttlig eller sämre status då årsminimumhalterna av löst syrgas i bottenvattnet vid nio av elva stationer understiger 6 mg O2/l.
Stationsmedelvärdena av siktdjup under augusti 2014–2016 varierade mellan 0,8–5,6 m med högst värden i den östra delen av Mälaren. De tre stationerna belägna i Stockholms län samt Ekoln och Prästfjärden uppnår god eller hög status med avseende på siktdjup, medan övriga stationer når otillfredsställande eller måttlig status utom Galten som klassificeras som dålig. Samtliga stationer bedöms uppnå hög status med avseende på försurning då mätningarna under 2014–2016 indikerar att Mälaren är opåverkad av försurning.
Växtplankton analyserades kvantitativt (klorofyll a, biomassa) och kvalitativt genom bestämning av växtplanktonsamhällets sammansättning. Klorofyll a-halterna under 2014–2016 indikerar hög till god status vid tre av stationerna och måttlig eller sämre status vid de resterande åtta. Vid fem av stationerna undersöktes växtplankton kvalitativt och resultatet påvisar måttlig status för samtliga stationer. Vid fyra av stationerna skedde bottenfaunaundersökningar i september 2016. Undersökningen indikerade varierande status (måttlig–hög). Statusklassningen av Björkfjärden och Görväln (hög) är dock mycket osäker då bedömningen baseras på få antal individer.