Under år 2001 togs 25 sedimentproppar i Mälaren, jämnt fördelade över hela sjön. Med hjälp av särskilda fosforanalyser, sk fosforfraktionering, beräknades att ungefär 100 760 ton (t) fosfor är lagrade i Mälarens sediment (0-30 cm) varav nästan 21 000 t tillhör den mobila fosforformen.
Mobil fosfor betyder att den förr eller senare kommer att lämna sedimentet och bidra till fosforkoncentrationen i vatten. Av den mobila fosforformen i Mälaren anses nästan 5 500 t vara naturligt medan resten härstammar från det senaste seklets fosforbelastning. Det beräknades att det årliga fosforläckaget från Mälarens sediment för närvarande är nästan 220 t. Fosforläckaget varierar markant från bassäng till bassäng. Utifrån den nuvarande fosforbelastning beräknades att det tar mellan 40 och 470 år, beroende på bassäng, innan fosforläckaget från en tidigare hög fosforbelastning upphör. Längst tid tar det i den djupaste bassängen eftersom ackumulationen av mobil fosfor har varit störst där.
Beräkningarna i denna rapport bör ses som en ungefärlig uppskattning hur stort sedimentens bidrag till fosforbelastningen är i Mälaren. Fosforläckaget är direkt kopplat till en genomsnittlig mängd fosfor som årligen tillförs till Mälaren. Det kan påpekas att fosfortillförseln från närområden är än så länge bara baserad på uppskattade värden. Är uppgifterna om fosfortillförseln inkorrekta blir alla beräkningarna felaktiga. Därför rekommenderas att en noggrann undersökning görs för att få exaktare uppgifter på fosfortillförseln. Med bättre kunskap om den externa fosforbelastningen kan fosforcykeln i Mälaren modelleras med hög tillförlitlighet.