Vid 2006 års inventering av submersa makrofyter i Mälaren har submersa makrofyter i elva utpekade “naturligt eutrofa sjöar med nate- eller dybladsvegetation” undersökts för Natura 2000 samt Vattendirektivet.
Lokaler I områdena har inventerats i transekter och utvalda delar inom områdenas strandlinjer har ”scannats” efter submers vegetation i syfte att hitta lämpliga lokaler som sedan har inventerats med fastställda metoder.
Undersökningens syfte har varit att utgöra underlag för bedömningar om områdenas bevarandestatus, ekologiska status samt revideringar av bevarandeplaner och bevarandemål.
De olika lokalerna representerar I sig ett stor variation, både förutsättningsmässigt och ur naturvärdessynpunkt. I Stora Ullfjärden hittades den rödlistade och fridlysta småsvaltingen Alisma Wahlenbergii.
Undersökningen bekräftar att nästan alla områden kan och borde klassificeras som naturtyp 3150, varav endast Sörfjärden och Ullfjärdarna bedöms att ha gynnsam bevarandestatus. Endast Strömsholm bedöms ha God ekologisk status.
Av de undersökta områdena bedöms ett fåtal som lämpliga för både uppföljning inom Natura 2000 och som miljöövervakningslokaler.